保護區地處長江和黃河的上游源頭地區，平均海拔約4500米，是長江和黃河的重要的水源涵養地。保護區總面積近67萬公頃，涉及五個鄉鎮（長沙貢瑪、呷依、宜牛、新榮、格孟），2013年全國第二次濕地資源調查中，保護區擁有各類濕地（河流、沼澤、湖泊）總面積18萬余公頃，占保護區總面積的27%。
保護區主要保護對象為高寒濕地生態系統及藏野驢等珍稀瀕危野生動物。據統計，境內分布有脊椎動物208種（國家一級保護16種，二級保護32種），維管植物441種。
2019年，石渠縣成立了長沙貢瑪國家級自然保護區服務中心，配齊工作人員，落實工作經費。石渠縣林草局局長曲多介紹，目前已完成保護區一期建設，包括2個保護站、3個保護點、300個左右界樁、5座瞭望塔、3個指路牌和25公里巡護道路。
